一九八零年九月五日经院党委批准，成立纪检组，一九七九年第二届党代会时选举产生第一届纪律检查委员会。二零一六年四月十五日召开中国中医科学院针灸研究所第一次党员大会（建所以来第八次党员大会），选举产生第一届纪律检查委员会。二零二一年九月二十九日召开中国中医科学院针灸研究所第二次党员大会（建所以来第九次党员大会），选举产生第二届纪律检查委员会。现任纪委书记焦拥政。
时间 | 届 次 | 书 记 | 副书记 |
| 1980.09.05 | 王特（纪检组长） | ||
| 1979.11.03 | 第一届 | 韩明德（兼） | |
| 1983.10 | 刘家瑛（1985．4调院） | ||
| 1985.04.13 | 王炳歧 | ||
| 1986.03.29 | 第二届 | 王炳歧 | |
| 1991.07.31 | 第三届 | 王炳歧（1993年调出） | |
| 1993.04.30 | 王德贤 | ||
| 1991.07.31 | 第四届 | 王德贤 | |
| 2001.05.25 | 第五届 | 王德贤 | |
| 2014.12.03 | 王军平 | ||
| 2016.04.15 | 第一届 | 王军平 | |
| 2021.09.29 | 第二届 | 焦拥政 |
