一九五一年十月三日建立党支部，党员九人。一九七三年一月二十四日由党支部改建为党委。目前党委下设八个党支部。二零一六年四月十五日召开中国共产党中国中医科学院针灸研究所第一次党员大会，选举产生第一届党委会（建所以来第八届党委）。二零二一年九月二十九日召开中国共产党中国中医科学院针灸研究所第二次党员大会，选举产生第二届党委会（建所以来第九届党委）。现任党委书记段玲。
一、党支部
时间 | 书记 | 副书记 |
| 1951.10 | 孙冠军 | |
| 1953.11 | 白国云 | |
| 1954.10 | 白国云 | 许式谦（兼） |
| 1955.12 | 石 斋 | |
| 1964.04 | 石 斋（兼） |
二、党 委
时间 | 届 次 | 书 记 | 副书记 |
| 1973.01.24 | 第一届 | 何万喜（1978年调出） | |
| 1976 初 | 韩明德（调入） | ||
| 1976 底 | 韩明德、田 德（调入） | ||
| 1978.04.03 | 韩明德、王雪苔、王特（女） | ||
| 1979.11.03 | 第二届 | 韩明德（1985．3调出） | 刘文泉（1979年调出） |
| 1985.03 | 邓良月（兼） | ||
| 1985.08.27 | 吴学璋 | ||
| 1986.03.29 | 第三届 | 吴学璋（1991．5．13调出） | |
| 1991.05.13 | 黎春元（代） | ||
| 1991.07.31 | 第四届 | 黎春元（兼） | |
| 1992 | 邓良月（代） | ||
| 1993.02.15 | 伍正国 | ||
| 1996.11 | 第五届 | 伍正国（1997年初退休） | |
| 1997.04.08 | 邓良月（代） | ||
| 1999.05.07 | 邓良月（代） | ||
| 2001.04.13 | 麻 颖 | ||
| 2001.05.25 | 第六届 | 麻 颖（2001．10调出） | |
| 2001.11.05 | 贺万才（代） | ||
| 2005.08.22 | 张 丽 | ||
| 2009.07.28 | 第七届 | 张 丽（2015年8月退休） | |
| 2015.08.01 | 王军平（暂时代理党务工会工作） | ||
| 2016.04.15 | 第一届 | 黄璐琦 | |
| 2017.02.15 | 段 玲 | ||
| 2019.09.27 | 景向红（兼） | ||
| 2021.09.29 | 第二届 | 段 玲 | 景向红（兼） |
