针灸医学工程研究室为国家中医药管理局医学成像和生物物理三级实验室，发展目标是：以医学影像技术和生物物理学为主要手段，对经络实质和针灸作用原理的研究，以及针灸诊疗技术的研发。本研究室配备了先进的实验设备和相关实验技术，包括小动物活体成像技术，激光多普勒和散斑血流成像技术，高光谱成像技术，红外热成像技术，组织灌注评估系统，生物流阻/组织液压测量系统等。具体研究方向包括1）经络的组织液通道实质研究；2）针灸效应的规律与生物学机制研究；3）经穴脏腑相关论的医学成像和生物物理研究；4）经络穴位生物理化特性的研究； 5）针灸诊疗设备的研发。
本研究室先后承担国家“七五”、“八五”和“九五”攻关课题、国家自然科学基金原创探索计划项目、优先资助课题和面上、青年课题等，中国中医科学院科技创新工程重大攻关项目，国家中医药行业专项、“973计划”子课题等20余项。获得部局级成果7项，院级成果7项，其中获中华中医药学会一等奖1项、中国中医科学院二等奖1项，国际针灸经络研究舍岩奖和最佳引文奖各1项。获得国家专利10余项。共发表研究论文200余篇，其中SCI收录论文约40余篇，EI收录论文10篇。论文总被引用达1800余次。
